《菊內留香》是一本充滿詩意與情感的小說，講述了在古代背景下，幾位角色之間復雜的情感糾葛與命運交織的故事。
故事的主線圍繞著一個名叫小菊的少女展開。她出身于一個普通的農家，天生麗質，性格溫婉，為人善良。小菊自幼便對周圍的花草樹木充滿了熱愛，尤其是她心中那朵美麗的菊花，象征著清雅與高潔。村子里的人都稱贊小菊與菊花般的清香，她的心靈如同菊花，純凈無瑕。
然而，小菊的命運并不平坦。在一個秋天的傍晚，她遇到了一個名叫阿君的少年。阿君是江湖上有名的劍客，性格剛毅，俠義心腸。兩人一見如故，阿君被小菊的純真吸引，而小菊則被阿君的俠氣所感染。隨著時間的推移，二人之間的感情逐漸升溫。
可這樣的溫馨并沒有持續太久，阿君的身份和過去卻如同陰影般籠罩著他們的幸福。他身后有著江湖恩怨，仇敵環伺，無法安然長久地留在小菊身邊。一次次的生死考驗使得兩人的感情經歷了磨難。小菊在阿君即將離去之際，默默承受著失去的痛苦，但她堅信，真愛終究會克服一切困難。
就在阿君面臨最危急的時刻，小菊選擇了站出來，幫助他化解危機。她用自己的智慧和勇氣，想要保護阿君。她的付出讓阿君感動不已，決心不再逃避自己的感情。在最危險的時刻，阿君抵擋住了敵人的襲擊，而小菊也用她的堅定信念守護了自己的愛。
與此同時，故事中的另一個角色，李公子位居高位，他暗戀小菊，心中對于小菊的愛慕卻無處傾訴。作為年輕有為的城中世子，他的生活被權力和責任包圍，但他始終無法忘記小菊的清麗。李公子的心中充滿了矛盾與掙扎，他想要追求自己的感情，但卻不愿意傷害小菊。他的出現，無形中增添了故事的復雜性，讓小菊必須面對選擇的困惑。
最后，在權力與真愛的沖突中，小菊、阿君與李公子都做出了各自的選擇。阿君為了愛人愿意放下仇恨與過往，選擇與小菊攜手共度余生。李公子則選擇成全，不再強求自己對小菊的占有，而是將一腔柔情化為祝福。小菊在兩者之間找到了屬于自己的答案，堅定地走向了自己所愛的人。
故事的結尾，小菊與阿君站在山頂，眺望遠方的夕陽，耳邊回響著菊花搖曳的聲音。歲月流轉，他們的愛如同那綻放的菊花，無論風雨如何，總能在艱難中生根發芽，綻放出最美的芬芳。李公子矗立在遠處，他的目光中藏著一絲不舍，但心中卻已經放下了那段無望的情感，微笑著祝福著他們的未來。
整個故事傳達了一種堅韌與希望的情感，讓人感受到生活中的愛與美，同時也反映出面對困境時，勇敢追求夢想的重要性。這個故事正是以菊花的清香作為寓意，象征著純真與真愛的永恒存在。