在一個遙遠的未來，地球的生態系統遭到了嚴重的破壞。人類的貪婪與無知使得自然界走向了衰亡，空氣中彌漫著塵埃，植物絕跡，動物滅絕，只有那些在城市廢墟中頑強生存的生物，依然在為自己的生存而掙扎。然而，在這樣的環境中，一個名為“共生恨”的組織悄然崛起，致力于拯救地球的同時，也將人類的歷史和道德推向了一個新的深淵。
主角小宇是一名年輕的科學家，他在一家生物研究所擔任科研助理，日復一日地研究著如何改造基因以適應這個日益惡化的環境。小宇有一個強烈的愿望，希望能通過自己的努力讓人類與自然重新和諧共處。就在他為此努力時，偶然得知了“共生恨”的存在。這個組織聲稱能夠通過極端手段重塑生態平衡，他們的理念是：只有在經歷徹底的毀滅后，人類才能學會珍惜生命。
小宇對這個理念感到震驚，同時也充滿了懷疑。他在一次偶然的機會中接觸到了該組織的成員，一個名叫小雪的女孩。小雪是“共生恨”的活動領袖，熱情似火，她的演講讓人魂牽夢縈。她提到，現有的所有系統都已經腐朽，唯有以暴力和極端方式才能喚醒沉睡的人類。小宇和小雪辯論了許久，最終不得不承認，盡管她的理想頗具爭議，卻也出于對未來深切的關懷。
隨著時間的推移，小宇逐漸被影響，開始參與組織的活動。他們在城市的廢墟中獻身于“重生”計劃——通過制造生化武器，釋放病毒以清洗人類，為自然界創造生存機會。小宇的內心開始沖突：他所追求的和諧與小雪的極端思想之間似乎有著不可調和的矛盾。
在一次行動中，組織準備釋放一種新型病毒，該病毒能夠迅速感染人類并重塑他們的基因。小宇對這個計劃感到恐懼，他意識到這種做法不僅會導致無數生命的消亡，還可能會造成不可逆轉的后果。他試圖說服小雪放棄這個計劃，但卻被指責為對理想的背叛。失落的小宇不得不輾轉反側，考慮離開這個組織。
就在他決心退出之際，組織內部發生了一次嚴重的分裂。一部分成員對小雪的極端主義產生了質疑，開始主張更溫和的措施以達成共生的目標。小宇看到希望，試圖與他們聯合，共同推翻小雪的計劃。然而，小雪得知后，憤怒地將小宇和叛逃者囚禁，這一切讓小宇更加意識到，盲目追求極端理想的人是多么危險和可怕。
在監禁中，小宇反思著自己的選擇。他想起了自己小時候在田野間奔跑的時光，那時自然給予了他無盡的快樂。心中飄蕩的往昔讓他堅定了一個信念：人與自然之間不該存在對立，而應是相互扶持的共生關系。恰在此時，組織的內訌達到了頂點，叛逃者們展開了反擊，他們設法釋放了小宇，并與他一起對抗小雪和她的追隨者。
經過一番激烈的沖突，小宇和叛逃者最終成功將小雪及其極端分子暫時壓制住。小雪被俘；在失去控制的瞬間，她的面孔浮現出痛苦與困惑。小宇看著昔日的好友，心中既感到惋惜也充滿了無奈。他知道小雪的初衷是好的，但被仇恨和極端思想扭曲了。
在恢復組織的過程中，小宇提出了一項嶄新的計劃：教育和引導人們重新認識自然的重要性，并通過科技手段緩解生態危機。剔除暴力和極端主義的思想，重新構建人類與自然之間的和諧關系。組織的其他成員開始逐步接受這一觀念，開始致力于生態修復與可持續發展的項目。
在經過長達數月的努力后，小宇和他的團隊逐漸收獲了成效。城市中的綠植重新煥發生機，空氣變得清新。人們也逐漸意識到，曾經的極端做法并不能解決問題，唯有團結、和諧才是長久之計。
最終，曾經的“共生恨”逐漸演變為“共生希望”，通過教化與科技的結合帶來了真正的改變。而小宇在過程中，亦找到了自己科研的真正價值——保護生命，珍惜自然。盡管曾經的道路充滿荊棘，但通過反思與成長，他終于明白了一個道理：只有在愛與理解的基石上，才能建立起人與自然永恒的共生關系。